Al igual que con el original Omnitrix, el Superomnitrix funciona como un receptor inalámbrico para la Corriente Coldon. El Superomnitrix reescribe el ADN del portador en un nivel cuántico, y crea energía masiva (y viceversa), según sea necesario.
En Cosmic Destruction, se descubre que el Superomnitrix puede ser programado para realizar determinados trabajos y lo hace hasta que se cumpla su funcion.
Al igual que con el Omnitrix, el Superomnitrix tiene un interfaz de selección que utiliza verde (o cualquier otro color como el rojo como se ve con Albedo antes de que Ben lo cambiara a verde) hologramas tridimensionales del alienigena seleccionado.
El Superomnitrix está vinculado la voz y el ADN de Ben, y responde a comandos de voz como el Omnitrix lo hizo.
Desactivando el Omnitrix: código de comando: 000 Desconectalo - 0
Autodestruccion: Omnitrix (o Superomnitrix) autodestruyete en 30 segundos: código de comando: 000 - destrucción 0
Autodestruccion Cancelada: Cancelar Autodestruccion, Código 10
Restablecimiento del Superomnitrix: Restablecer Superomnitrix Código 10
Cancelar Restablecimiento del Superomnitrix: Restablecer Superomnitrix Abortar secuencia código 10
Overide: Función Comando Código overide 10
En la página web de Cosmic Destruction, y de acuerdo a Dwayne McDuffie, la función de la evolución funciona mediante la colocación de las especies seleccionadas en una simulación, hasta el ADN, de todo el planeta a la guerra civil de ancho período prolongado de tiempo, un millón de años más o menos, en lo que se describe como un "escenario peor", el ADN real simplemente se modifica para que coincida con el nuevo ADN. Esta rutina de supervivencia del más apto explica por qué la evolución es más centrada en luchar contra las formas de su línea de base.
Sirve como comunicador cuando se transforma y no esta transformado, al igual que el Omnitrix,
El Superomnitrix también tiene un control maestro, que aún no se ha activado (Confirmado por Dwayne McDuffie).
El Superomnitrix siempre entra en modo de captura cuando hay una muestra de ADN que no reconoce en sus proximidades, salvo en Escapando de Aggregor, donde hasta después de haber dejado a Galapagus, entró en modo de captura .
Probablemente hay muchas maneras de quitar el Superomnitrix de la muñeca, 2 de ellos se ven en la serie. La primera es a través de comandos de voz (usado por Ben), la segunda es pulsando el botón negro al lado de la línea (utilizado por Albedo). Ben hasta ahora sabe de otras dos maneras de quitar el Superomnitrix.
Se muestra en Videojuegos que el Superomnitrix tiene AI (Inteligencia Artificial), como el Omnitrix.
Se puede detectar y medir la radiación, se ve en Un Peligro Tóxico.
Se pueden hacer modificaciones a las formas alienigenas (la apariencia de Nanomech, la piel extra de Fantasmático, el traje de NRG, la capacidad de hablar de varios aliens, etc) para hacer las formas más soportables.
El Superomnitrix puede cambiar la ropa que usan los aliens, pero Ben no sabe muy bien cómo funciona la característica. Se demuestra que los aliens que regresan ahora llevan ropa exclusiva para ellos (por ejemplo, Cuatrobrazos). Esto se debe a que Albedo individualmente aplico esta función para cada uno de los alienigenas.
Hay un código de bloqueo en el Omnitrix/Superomnitrix que puede bloquear las transformaciones de Ben
De acuerdo con Dwayne McDuffie el Superomnitrix no sólo escanea alienigenas sino que también elementos necesarios de ellos, por ejemplo, ropa para Cuatrobrazos, cinturon soportivo para Cerebrón, traje contención para NRG, etc
El Superomnitrix no posee la capacidad de revivir una especie almacenada en Primus como el Omnitrix era capaz ,debido a que no se completo correctamente.
Ben le dijo a Kevin que instalara una función de seguridad de bloqueo de ADN para evitar que se transforma en Alien X por accidente y por Albedo. Tanto Gwen y Kevin llevan una llave especial que, cuando se insertan en los lados del Superomnitrix, desbloquea el ADN Celestialsapian para uso temporal.
En fusionado cuando Ra'ad le dispara al superomnitrix tiene modo de proteccion para proteger a quien lo tenga.
Modo Rojo Albedo.
Modo amarillo escaneo de ADN.Modo Verde es la funcion de Ben.